Les cours d'harmonie et de contrepoint, aussi appelés cours d'écriture, s'adressent à des musiciens aux compétences solfégiques et théoriques déjà avancées. Il s'agira ici d'étudier le fonctionnement de l'harmonie tonale, c'est-à-dire du langage ayant dominé la musique durant plus de 3 siècles et qui sert aujourd'hui de référence pour la musique de variété.

Le contrepoint sera l'étude de la musique prise sous son angle "horizontal", c'est-à-dire la longue évolution de la polyphonie du 9-ème au 18-ème siècle. L'étude du contrepoint rigoureux sera prise comme modèle et nous en chercherons la mise en pratique essentiellement dans l'œuvre de Jean-Sébastien Bach.